Moti në Skënderaj karakterizohet nga stinë të ndryshme, me dimra të ftohtë dhe reshje bore të rralla, ndërsa verët janë të ngrohta dhe kryesisht të thata. Gjatë pranverës dhe vjeshtës, reshjet janë më të shpeshta, duke sjellë një klimë të butë dhe të përshtatshme për bujqësi.
